D3HOM         Version  5/13/91
X-axis: >HUMRSA16
Y-axis: >HUMRSA16
SIMILARITY RANGE:  10      MIN.PERCENT SIMILARITY:  60
SCALE FACTOR:    0.95      COMPRESSION:             20

|---- AluI family sequence ---|   |-- eight 66bp repeats ---|
              200       400       600       800      1000      1200

       A        .         .         .         .         .         .
        A R     .         .         .         .         .         .
         A      .         .    T    .         .         .         .
        R A     .         .         .         .         .         .
           A    .         .     S   .         .         .         .
            A   .         .  T    U .         .         .         .
             A  .   T     .         .         .         .         .
              A .         .         .         .         .         .
               A.         .      S  .         .         .         .
   200 .........A......R...........................................
                .A     TLT.         .         .         .         .
                . A     J .         .         .         .         .
                .  A  T   .T        .         .         .         .
             T  .   A     . KK      .         .         .         .
                .    A    .  KO     .         .         .     U   .
                .  T  A  R.     T   .         .         .         .
                RT     A  .         .         .         .         .
                .LJ     A .         .         .         .         .
                .T    R  AT         .         T         .         .
   400 ..................TA........................................
                .  T      .A        .         .         .         .
                .   K     . A       .         .         .         .
            T   .   KK    .  AA     .         .         .         .
                .    O    .  AA     .         .         .         .
         T      .         .    A    .         .         .         .
           S    .     T   .     A   .         .         .         .
               S.         .      A  .         .         .         .
            U   .         .       A .         .         .         .
                .         .        ARNU  U PU QQ QOU SR QTR  U    .
   600 ............................RAHFOJJ.FF.KHJNHITJD.EFSJJI.....
                .         .        NHAJIGD DATKALQEDTHAQFAJIDK    .
                .         .        UFJA CDCCAAICC FDCHCHDADEHD    .
                .         .         OI ATLAAIAAIAAPLA ICCIDAL O   .
                .         .         JGCTADUACJJCATDH DF FDJCDJ    .
                .         .        UJDDLDA HDDIDAJFF JDKHDHFFK   T.
                .         .         . CAU A  AA AAUFA  CC DA OO   .
                .         .        PFDCAAH ACJHGEFFDQHCSDAEAHF    .
                .         .        UFAAICD CARIACQDDTFATDADEDD    .
                .         .         .TAAJDAJRA.LAAIDAL CHLDCTFO   .
   800 ..................T.........QKKIAJIAHI.ATKADKCHMCCKNCMOP....
                .         .        QHACICD GALTANQAD DA CANECF    .
                .         .         JLCAAAAECAKNA HFCHGFFEFCFI    .
                .         .        QNQ ATJAFQAAQ A TAOQCCQDCT O   .
                .         .        OHEFPDFUFDIDAH AK DE AALKFM    .
                .         .        UIDDLHFFDDDKDFTKA MDFHDDKFF   U.
                .         .         TTCA  AQTAC CA  A  CI DCTKO   .
                .         .        SJHH DJ HFLHDHODM AL DDLJFO    .
                .         .        RDACIFD CA MAGQED LA HADGCF    .
                .         .         .QHC KCSTCC FC FC  A. AA HM  U.
  1000 ............................QEFDCFHCDDHCCFCAHIDH.AFICHJU....
                .         .        TFAAIDD AALKAEQAD DA FATGCD    .
                .         .        RSJDDJHDEDDNNFDLDDLDAITA MD   S.
                .         .         JIEACFAAECCECCKKCJGACG AKKM   .
                .         .         JDHLDF HDTMCFTFFTFC HCMKAM    .
                .         .        UIKD JKOFDFOFI MFKOFHJDDKMA   U.
                .    U    .         .  O  O  OP  O  O  MU  M  AQ  .
                .         .         .         .         .     QA  .
                .         .         .         .         .       A .
                .         .         .    T    .    U   U. S  U   A.
  1200 ...........................................................A