Index of /~psgendb/birchhomedir/local/pkg/MeV_4_8_0/documentation/manual

	Name	Last modified	Size	Description
	Parent Directory		-
	workingwithclusters...>	2011-09-09 05:55	14K
	vd3.jpg	2011-09-09 05:55	179K
	vd2.jpg	2011-09-09 05:55	171K
	vari.jpg	2011-09-09 05:55	57K
	usc7.jpg	2011-09-09 05:55	44K
	usc6.jpg	2011-09-09 05:55	110K
	usc5.jpg	2011-09-09 05:55	66K
	usc4.jpg	2011-09-09 05:55	80K
	usc3.jpg	2011-09-09 05:55	118K
	usc2.jpg	2011-09-09 05:55	73K
	usc1.jpg	2011-09-09 05:55	80K
	usc.html	2011-09-09 05:55	11K
	trn4.jpg	2011-09-09 05:55	111K
	trn3.jpg	2011-09-09 05:55	40K
	trn2.jpg	2011-09-09 05:55	111K
	trn1.jpg	2011-09-09 05:55	46K
	trn.html	2011-09-09 05:55	10K
	test5.jpg	2011-09-09 05:55	66K
	test4.jpg	2011-09-09 05:55	105K
	test3.jpg	2011-09-09 05:55	99K
	test2.jpg	2011-09-09 05:55	93K
	test1.jpg	2011-09-09 05:55	68K
	test.html	2011-09-09 05:55	10K
	tease2.jpg	2011-09-09 05:55	137K
	svm4.jpg	2011-09-09 05:55	51K
	svm3.jpg	2011-09-09 05:55	129K
	svm2.jpg	2011-09-09 05:55	78K
	svm1.jpg	2011-09-09 05:55	58K
	svm.html	2011-09-09 05:55	11K
	surv.html	2011-09-09 05:55	4.8K
	sota3.jpg	2011-09-09 05:55	108K
	som2.jpg	2011-09-09 05:55	101K
	script.html	2011-09-09 05:55	16K
	script-diversity-fil..>	2011-09-09 05:55	4.9K
	script-centroid-vari..>	2011-09-09 05:55	6.9K
	scr20.jpg	2011-09-09 05:55	17K
	scr19.jpg	2011-09-09 05:55	14K
	scr18.jpg	2011-09-09 05:55	20K
	scr17.jpg	2011-09-09 05:55	17K
	scr13.jpg	2011-09-09 05:55	158K
	scr12.jpg	2011-09-09 05:55	99K
	scr11.jpg	2011-09-09 05:55	272K
	scr10.jpg	2011-09-09 05:55	63K
	scr9.jpg	2011-09-09 05:55	62K
	scr8.jpg	2011-09-09 05:55	101K
	scr7.jpg	2011-09-09 05:55	88K
	scr6.jpg	2011-09-09 05:55	92K
	scr5.jpg	2011-09-09 05:55	62K
	scr4.jpg	2011-09-09 05:55	61K
	scr3.jpg	2011-09-09 05:55	136K
	scr2.jpg	2011-09-09 05:55	109K
	scr1.jpg	2011-09-09 05:55	70K
	sam3.jpg	2011-09-09 05:55	51K
	sam2.jpg	2011-09-09 05:55	89K
	sam1.jpg	2011-09-09 05:55	79K
	sam.html	2011-09-09 05:55	8.9K
	rp3.jpg	2011-09-09 05:55	39K
	rp2.jpg	2011-09-09 05:55	52K
	rp1.jpg	2011-09-09 05:55	94K
	rp.html	2011-09-09 05:55	4.4K
	result.jpg	2011-09-09 05:55	104K
	ptm2.jpg	2011-09-09 05:55	90K
	ptm1.jpg	2011-09-09 05:55	94K
	ptm.html	2011-09-09 05:55	4.8K
	pic2.jpg	2011-09-09 05:55	50K
	percentcut.jpg	2011-09-09 05:55	47K
	pca2.jpg	2011-09-09 05:55	69K
	pca.jpg	2011-09-09 05:55	107K
	pca.html	2011-09-09 05:55	5.0K
	oome.html	2011-09-09 05:55	2.0K
	nonpar9.jpg	2011-09-09 05:55	73K
	nonpar8.jpg	2011-09-09 05:55	75K
	nonpar7.jpg	2011-09-09 05:55	111K
	nonpar6.jpg	2011-09-09 05:55	74K
	nonpar5.jpg	2011-09-09 05:55	95K
	nonpar4.jpg	2011-09-09 05:55	66K
	nonpar3.jpg	2011-09-09 05:55	78K
	nonpar2.jpg	2011-09-09 05:55	69K
	nonpar1.jpg	2011-09-09 05:55	89K
	nonpar.html	2011-09-09 05:55	23K
	nmf4.jpg	2011-09-09 05:55	113K
	nmf3.jpg	2011-09-09 05:55	117K
	nmf2.jpg	2011-09-09 05:55	31K
	nmf1.jpg	2011-09-09 05:55	58K
	network.jpg	2011-09-09 05:55	57K
	minet2.jpg	2011-09-09 05:55	41K
	minet.html	2011-09-09 05:55	5.4K
	mev_manual.html	2011-09-09 05:55	2.9K
	mev_manual.css	2011-09-09 05:55	1.4K
	merge.jpg	2011-09-09 05:55	30K
	m1.jpg	2011-09-09 05:55	122K
	lm3.jpg	2011-09-09 05:55	144K
	lm2.jpg	2011-09-09 05:55	81K
	lm1.jpg	2011-09-09 05:55	83K
	lm.html	2011-09-09 05:55	6.5K
	limma3.jpg	2011-09-09 05:55	167K
	limma2.jpg	2011-09-09 05:55	174K
	limma1.jpg	2011-09-09 05:55	45K
	limma.html	2011-09-09 05:55	4.9K
	license.html	2011-09-09 05:55	95
	lem13.jpg	2011-09-09 05:55	114K
	lem12.jpg	2011-09-09 05:55	162K
	lem11.jpg	2011-09-09 05:55	98K
	lem10.jpg	2011-09-09 05:55	99K
	lem9.jpg	2011-09-09 05:55	70K
	lem8.jpg	2011-09-09 05:55	123K
	lem7.jpg	2011-09-09 05:55	229K
	lem6.jpg	2011-09-09 05:55	127K
	lem5.jpg	2011-09-09 05:55	186K
	lem4.jpg	2011-09-09 05:55	69K
	lem3.jpg	2011-09-09 05:55	412K
	lem2.jpg	2011-09-09 05:55	182K
	lem1.jpg	2011-09-09 05:55	130K
	lem.html	2011-09-09 05:55	28K
	knn.html	2011-09-09 05:55	6.2K
	kms.jpeg	2011-09-09 05:55	44K
	kms.html	2011-09-09 05:55	4.3K
	kmc2.jpg	2011-09-09 05:55	91K
	kmc.jpg	2011-09-09 05:55	88K
	k3.jpg	2011-09-09 05:55	64K
	k2.jpg	2011-09-09 05:55	81K
	k1.jpg	2011-09-09 05:55	125K
	img16.jpg	2011-09-09 05:55	76K
	img12.jpg	2011-09-09 05:55	92K
	img10.jpg	2011-09-09 05:55	37K
	hcl_nexus_output_par..>	2011-09-09 05:55	1.6K
	hcl_newick_output_pa..>	2011-09-09 05:55	1.1K
	gsh01.png	2011-09-09 05:55	92K
	gsh.html	2011-09-09 05:55	4.2K
	gsea7.jpg	2011-09-09 05:55	115K
	gsea6.jpg	2011-09-09 05:55	113K
	gsea5.jpg	2011-09-09 05:55	53K
	gsea4.jpg	2011-09-09 05:55	95K
	gsea3.jpg	2011-09-09 05:55	97K
	gsea2.jpg	2011-09-09 05:55	117K
	gsea1.jpg	2011-09-09 05:55	88K
	gsea.html	2011-09-09 05:55	8.8K
	goseq2.gif	2011-09-09 05:55	111K
	goseq1.gif	2011-09-09 05:55	156K
	goseq.html	2011-09-09 05:55	2.6K
	genepix.jpg	2011-09-09 05:55	52K
	geneanno.jpg	2011-09-09 05:55	124K
	gdm5.jpg	2011-09-09 05:55	82K
	gdm4.jpg	2011-09-09 05:55	105K
	gdm3.jpg	2011-09-09 05:55	58K
	gdm2.jpg	2011-09-09 05:55	105K
	gdm1.jpg	2011-09-09 05:55	45K
	gdm.html	2011-09-09 05:55	11K
	gcova.html	2011-09-09 05:55	3.4K
	gag.html	2011-09-09 05:55	4.4K
	g3.jpg	2011-09-09 05:55	85K
	g2.jpg	2011-09-09 05:55	85K
	g1.jpg	2011-09-09 05:55	103K
	fom3.jpg	2011-09-09 05:55	110K
	fom2.jpg	2011-09-09 05:55	95K
	fom1.jpg	2011-09-09 05:55	68K
	figure6.jpg	2011-09-09 05:55	85K
	expressionimage.jpg	2011-09-09 05:55	104K
	ex2cl.jpg	2011-09-09 05:55	93K
	ex1cl.jpg	2011-09-09 05:55	87K
	equation2.jpg	2011-09-09 05:55	18K
	equation 1.jpg	2011-09-09 05:55	17K
	edger.html	2011-09-09 05:55	3.1K
	ec2.jpg	2011-09-09 05:55	182K
	ec1.jpg	2011-09-09 05:55	178K
	ease5.jpg	2011-09-09 05:55	81K
	ease4.jpg	2011-09-09 05:55	62K
	ease3.jpg	2011-09-09 05:55	85K
	ease2.jpg	2011-09-09 05:55	60K
	ease1.jpg	2011-09-09 05:55	72K
	ease.html	2011-09-09 05:55	22K
	e10.jpg	2011-09-09 05:55	14K
	e9.jpg	2011-09-09 05:55	16K
	e8.jpg	2011-09-09 05:55	15K
	e7.jpg	2011-09-09 05:55	19K
	e6.jpg	2011-09-09 05:55	22K
	e5.jpg	2011-09-09 05:55	19K
	e4.jpg	2011-09-09 05:55	18K
	e3.jpg	2011-09-09 05:55	15K
	e2.jpg	2011-09-09 05:55	15K
	e1.jpg	2011-09-09 05:55	16K
	displayoptions.html	2011-09-09 05:55	12K
	detect.jpg	2011-09-09 05:55	109K
	deseq.html	2011-09-09 05:55	2.5K
	degseq.html	2011-09-09 05:55	2.3K
	dam4.jpg	2011-09-09 05:55	89K
	dam3.jpg	2011-09-09 05:55	124K
	dam2.jpg	2011-09-09 05:55	88K
	dam.jpg	2011-09-09 05:55	46K
	dam.html	2011-09-09 05:55	6.7K
	d1.jpg	2011-09-09 05:55	40K
	cutofffilter2.jpg	2011-09-09 05:55	46K
	cutofffilter1.jpg	2011-09-09 05:55	44K
	createout.html	2011-09-09 05:55	3.8K
	coschdia.jpg	2011-09-09 05:55	66K
	cosch.jpg	2011-09-09 05:55	108K
	contri.html	2011-09-09 05:55	95
	compare.html	2011-09-09 05:55	24K
	coa3.jpg	2011-09-09 05:55	102K
	coa2.jpg	2011-09-09 05:55	108K
	coa1.jpg	2011-09-09 05:55	42K
	coa.html	2011-09-09 05:55	3.5K
	clvalidres.jpg	2011-09-09 05:55	110K
	clvalidinit.jpg	2011-09-09 05:55	84K
	clvalid.html	2011-09-09 05:55	4.2K
	clustermanger.jpg	2011-09-09 05:55	105K
	cgh22.jpg	2011-09-09 05:55	168K
	cgh21.jpg	2011-09-09 05:55	124K
	cgh20.jpg	2011-09-09 05:55	128K
	cgh19.jpg	2011-09-09 05:55	144K
	cgh18.jpg	2011-09-09 05:55	124K
	cgh17.jpg	2011-09-09 05:55	75K
	cgh16.jpg	2011-09-09 05:55	154K
	cgh15.jpg	2011-09-09 05:55	97K
	cgh14.jpg	2011-09-09 05:55	126K
	cgh13.jpg	2011-09-09 05:55	218K
	cgh12.jpg	2011-09-09 05:55	214K
	cgh10.jpg	2011-09-09 05:55	125K
	cgh9.jpg	2011-09-09 05:55	134K
	cgh8.jpg	2011-09-09 05:55	82K
	cgh7.jpg	2011-09-09 05:55	121K
	cgh6.jpg	2011-09-09 05:55	118K
	cgh5.jpg	2011-09-09 05:55	177K
	cgh4.jpg	2011-09-09 05:55	57K
	cgh3.jpg	2011-09-09 05:55	149K
	cgh2.jpg	2011-09-09 05:55	201K
	cgh1.jpg	2011-09-09 05:55	208K
	bn5.jpg	2011-09-09 05:55	96K
	bn4.jpg	2011-09-09 05:55	23K
	bn3.jpg	2011-09-09 05:55	64K
	bn2.jpg	2011-09-09 05:55	90K
	bn1.jpg	2011-09-09 05:55	84K
	bn.html	2011-09-09 05:55	11K
	betr3.jpg	2011-09-09 05:55	104K
	betr2.jpg	2011-09-09 05:55	99K
	betr1.jpg	2011-09-09 05:55	46K
	betr.html	2011-09-09 05:55	4.5K
	attr9.jpg	2011-09-09 05:55	67K
	attr8.jpg	2011-09-09 05:55	68K
	attr7.jpg	2011-09-09 05:55	91K
	attr6.jpg	2011-09-09 05:55	78K
	attr5.jpg	2011-09-09 05:55	97K
	attr4.jpg	2011-09-09 05:55	98K
	attr3.png	2011-09-09 05:55	48K
	attr2.png	2011-09-09 05:55	26K
	attr1.png	2011-09-09 05:55	21K
	attr.html	2011-09-09 05:55	5.7K
	app18.jpg	2011-09-09 05:55	57K
	app16.jpg	2011-09-09 05:55	117K
	app14.jpg	2011-09-09 05:55	74K
	app13.jpg	2011-09-09 05:55	71K
	app12.jpg	2011-09-09 05:55	90K
	app11.jpg	2011-09-09 05:55	56K
	app10.jpg	2011-09-09 05:55	58K
	app7.html	2011-09-09 05:55	1.2K
	app6.jpg	2011-09-09 05:55	90K
	app6.html	2011-09-09 05:55	12K
	app5.jpg	2011-09-09 05:55	81K
	app5.html	2011-09-09 05:55	4.3K
	app4.jpg	2011-09-09 05:55	152K
	app4.html	2011-09-09 05:55	3.9K
	app3.jpg	2011-09-09 05:55	228K
	app3.html	2011-09-09 05:55	6.1K
	app2.jpg	2011-09-09 05:55	81K
	app2.html	2011-09-09 05:55	5.3K
	app1.jpg	2011-09-09 05:55	65K
	app.html	2011-09-09 05:55	34K
	anova2.jpg	2011-09-09 05:55	88K
	anova2.html	2011-09-09 05:55	4.3K
	anova1.jpg	2011-09-09 05:55	110K
	anova.html	2011-09-09 05:55	3.6K
	adjustdatamenu.jpg	2011-09-09 05:55	167K
	ViewerDescriptions.html	2011-09-09 05:55	17K
	UM.html	2011-09-09 05:55	11K
	The MeV MAGE-TAB fil..>	2011-09-09 05:55	71K
	Tease.html	2011-09-09 05:55	9.2K
	TableofContents.html	2011-09-09 05:55	15K
	TV.jpg	2011-09-09 05:55	126K
	TS.jpg	2011-09-09 05:55	65K
	TEASETree.jpg	2011-09-09 05:55	69K
	TEASE1.jpg	2011-09-09 05:55	69K
	Step 1.jpg	2011-09-09 05:55	92K
	StartingMEV.html	2011-09-09 05:55	2.7K
	Spotinfo.jpg	2011-09-09 05:55	85K
	Savemate.jpg	2011-09-09 05:55	91K
	ST2.jpg	2011-09-09 05:55	110K
	ST.html	2011-09-09 05:55	4.0K
	SOTA.jpg	2011-09-09 05:55	36K
	SOTA.html	2011-09-09 05:55	7.9K
	SOM1.jpg	2011-09-09 05:55	72K
	SOM.html	2011-09-09 05:55	5.8K
	SLR.jpg	2011-09-09 05:55	87K
	SLE.jpg	2011-09-09 05:55	104K
	SID.jpg	2011-09-09 05:55	91K
	RN.jpg	2011-09-09 05:55	60K
	RN.html	2011-09-09 05:55	5.3K
	QTC2.jpg	2011-09-09 05:55	90K
	QTC1.jpg	2011-09-09 05:55	90K
	QTC.html	2011-09-09 05:55	4.1K
	NodeHeightGraph.jpg	2011-09-09 05:55	58K
	Node Height Graph.jpg	2011-09-09 05:55	28K
	NMF.html	2011-09-09 05:55	8.1K
	Mod.html	2011-09-09 05:55	2.5K
	MEVpic.jpg	2011-09-09 05:55	79K
	MEVFORMAT.jpg	2011-09-09 05:55	93K
	Loading the Data.html	2011-09-09 05:55	9.2K
	Loading-rnaseq-data...>	2011-09-09 05:55	31K
	Loading-mev-data.html	2011-09-09 05:55	4.6K
	Loading-magetab-data..>	2011-09-09 05:55	6.9K
	Loading-geo-data.html	2011-09-09 05:55	4.3K
	Loading-genepix-data..>	2011-09-09 05:55	1.4K
	Loading-dchip-data.html	2011-09-09 05:55	31K
	Loading-agilent-data..>	2011-09-09 05:55	1.7K
	Loading-affy-data.html	2011-09-09 05:55	8.3K
	LURL.jpg	2011-09-09 05:55	61K
	KMC.html	2011-09-09 05:55	3.6K
	Hierarchical tree wi..>	2011-09-09 05:55	70K
	HCL Tree with distan..>	2011-09-09 05:55	107K
	HCLTreeConfiguration..>	2011-09-09 05:55	81K
	HCL Initialization D..>	2011-09-09 05:55	101K
	HCL.html	2011-09-09 05:55	8.5K
	GeneralInformation.html	2011-09-09 05:55	2.9K
	Geneimport.jpg	2011-09-09 05:55	57K
	GeneClus.jpg	2011-09-09 05:55	98K
	FOM.html	2011-09-09 05:55	5.8K
	EI.jpg	2011-09-09 05:55	57K
	DSS.jpg	2011-09-09 05:55	73K
	Cast2.jpg	2011-09-09 05:55	81K
	Cast1.jpg	2011-09-09 05:55	47K
	CSLD.jpg	2011-09-09 05:55	113K
	CLustermange.jpg	2011-09-09 05:55	95K
	CG.jpg	2011-09-09 05:55	114K
	CAST.html	2011-09-09 05:55	2.7K
	CAD.jpg	2011-09-09 05:55	62K
	AdjustingtheData.html	2011-09-09 05:55	17K
	ABCD.jpg	2011-09-09 05:55	18K
	4.18.1.jpg	2011-09-09 05:55	83K
	4.16.1.jpg	2011-09-09 05:55	76K
	4.14.1.jpg	2011-09-09 05:55	70K
	4.13.1.jpg	2011-09-09 05:55	57K
	4.12.1.jpg	2011-09-09 05:55	55K
	4.11.1.jpg	2011-09-09 05:55	112K
	4.10.1.jpg	2011-09-09 05:55	63K
	4.7.1.jpg	2011-09-09 05:55	56K
	4.6.1.jpg	2011-09-09 05:55	38K
	4.4.1.jpg	2011-09-09 05:55	63K
	4.3.1.jpg	2011-09-09 05:55	117K
	2anova1.jpg	2011-09-09 05:55	121K