# ssearch3 -k 500 -z 1 -m 0 -E 0.01 bio1062259707855634822.tmp.seq1 bio1062259707855634822.tmp.seq2 SSEARCH performs a Smith-Waterman search version 36.3.8i Sept, 2021 Please cite: T. F. Smith and M. S. Waterman, (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197; W.R. Pearson (1991) Genomics 11:635-650 Query: bio1062259707855634822.tmp.seq1 1>>>QHD43416 - 1273 aa Library: bio1062259707855634822.tmp.seq2 1255 residues in 1 sequences Statistics: (shuffled [500]) MLE statistics: Lambda= 0.1094; K=0.001776 statistics sampled from 1 (1) to 500 sequences Algorithm: Smith-Waterman (SSE2, Michael Farrar 2006) (7.2 Nov 2010/SIMDe Nov 2020) Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 Scan time: 0.280 The best scores are: s-w bits E(1) ABF65836 (1255) 6669 1062.1 0 >>ABF65836 (1255 aa) s-w opt: 6669 Z-score: 5674.1 bits: 1062.1 E(1): 0 Smith-Waterman score: 6669; 76.0% identity (91.5% similar) in 1277 aa overlap (1-1273:1-1255) 10 20 30 40 50 QHD434 MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQ--LPPAYTN--SFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFL ::.::..: :.:.. .. : . : ::. : :::::::..:::..:. :::::: ABF658 MFIFLLFLTLTSGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 QHD434 PFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQS ::.:::: ::.:. . : :::.::.::.:::.:::::..:::.::.:...:.:: ABF658 PFYSNVTGFHTIN-------HTFGNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 QHD434 LLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFL ..:.::.:::::..:.:..:..::..: .. ... ....: ::::::.:. : ABF658 VIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAV----SKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFS 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 QHD434 MDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINIT .:. :.::::.:::::::: ::.. .:. . ::..:::::.::..:.:. ::.::::: ABF658 LDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINIT 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 QHD434 RFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPL :...: . ..: ... : ..::::.::::.: ::.:::.:::::::::::. .:: ABF658 NFRAIL----TAFSP--AQDIWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 QHD434 SETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRK .: ::..::: ..::::::::::: :. ..:::::::::::::::::::.: :::::.:: ABF658 AELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 QHD434 RISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTG .::::::::::::::. :::::::::: ::::::::.::::::::..::.:::::::::: ABF658 KISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTG 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 QHD434 KIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAG :::::::::::: :::.:::. :.:. ::.:: :: .:...:.:::::::. .. ABF658 VIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNHNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPD 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 QHD434 STPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKN . ::. ..:::.::..::: :.:.:::::::::::::::.::::::::: ::.:.:: ABF658 GKPCTP-PALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKN 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 QHD434 KCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVS .:::::::::::::::: :.:.: ::::::::..: ::.::::.: :::::.:::::::: ABF658 QCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVS 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 QHD434 VITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHV :::::::.:..:::::::::::.: .:::::::::.::.::::.:::::.:::::::::: ABF658 VITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHV 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 QHD434 NNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPT ..::::::::::::::::.: . ::....::.::::::::..:.:::::.::::: ABF658 DTSYECDIPIGAGICASYHTVS----LLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPT 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 QHD434 NFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDK ::.::.:::..::::.::::::.::::::::::.:::::::::::::::::.:::.:::. ABF658 NFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDR 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 QHD434 NTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQ ::.::::::::.:::: .: ::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::.:: ABF658 NTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQ 760 770 780 790 800 810 840 850 860 870 880 890 QHD434 YGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQI ::.::::: ::::::::::::::::::::::.::: ::.::..:: :.:::::::::::: ABF658 YGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQI 820 830 840 850 860 870 900 910 920 930 940 950 QHD434 PFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNA ::::::::::::::::::::::::: ::::::.::..::.::..:..::::::::::::: ABF658 PFAMQMAYRFNGIGVTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNA 880 890 900 910 920 930 960 970 980 990 1000 1010 QHD434 QALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ABF658 QALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAA 940 950 960 970 980 990 1020 1030 1040 1050 1060 1070 QHD434 EIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFT ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::.::: ABF658 EIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFT 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1080 1090 1100 1110 1120 1130 QHD434 TAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNT :::::::.:::.:::::::: ::: ::.:::::. :::::::::::::::::::::.::: ABF658 TAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNT 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1140 1150 1160 1170 1180 1190 QHD434 VYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ABF658 VYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNES 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1200 1210 1220 1230 1240 1250 QHD434 LIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKF :::::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::: ABF658 LIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKF 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1260 1270 QHD434 DEDDSEPVLKGVKLHYT ::::::::::::::::: ABF658 DEDDSEPVLKGVKLHYT 1240 1250 1273 residues in 1 query sequences 1255 residues in 1 library sequences Tcomplib [36.3.8i Sept, 2021] (4 proc in memory [0G]) start: Sat Nov 6 15:32:20 2021 done: Sat Nov 6 15:32:20 2021 Total Scan time: 0.280 Total Display time: 0.040 Function used was SSEARCH [36.3.8i Sept, 2021]