September 22, 2004, Dr. Brian Fristensky, University of Manitoba
 
 Description: Convert a GDE flatfile into another format 
 
 Synopsis: flatcnv.py infile outfile
 
 Files: infile      GDE flat file, with name on line 1, followed by
 
                   comma separated list of tokens GI numbers
 
       outfile     GDE flat file, with name on line 1, followed by
 
                   comma-separated list of integers 
 
@modified: May 26 2010
@author: Dale Hamel
@contact: umhameld@cc.umanitoba.ca

Modules
		os sys

Classes
		FILE IDLST Parameters   class FILE     Wrapper class for files     Methods defined here: __init__(self, FILENAME, MODE) @param FILENAME: The name of the file @type FILENAME: str @param MODE: Type of file operation (read/write) @type MODE:str : (r, w, rw)   class IDLST     Wrapper class for ID lists     Methods defined here: __init__(self) FIXME   class Parameters     Wrapper class for command line parameters     Methods defined here: __init__(self) Initializes arguments:       IFN=""       OFN=""       OUTTYPE="" Then calls read_args() to fill in their values from command line read_args(self) Read command line arguments into a Parameter object

Functions
		GETGDELIST(INFILE, NAMEFLAG, L) Read in old and new strings, striping  leading and trailing whitespace, including newline characters. WRITECSVFILE(F, L) Write the list as a single line of comma-separated values WRITENAMEFILE(F, LST) Write the list with one item per line main() Called when not in documentation mode.

Data
		BM = <birchlib.Birchmod instance> PROGRAM = 'flatcnv.py : ' USAGE = '\n\tUSAGE: flatcnv.py [options] infile outfile' blib = '/home/u11/umhameld/public_html/local/pylib/'